Hệ thống học, phát sinh chủng loài và phân loại học của nó vẫn là chủ đề của tranh luận đáng kể trong đầu thế kỷ 21. Điều này là do loài chim này tạo thành một tổ hợp loài bí ẩn với chìa vôi vàng phương Đông (M. tschutschensis ) và chìa vôi vàng phương Tây (M. flava). Đơn vị phân loại nào trong số này được gán với chính xác với quần thể nào là điều chưa thể dung giải trong tương lai gần.[3]

Tên Latinh của chi có nghĩa gốc là "vật di chuyển nhỏ", nhưng có lẽ các tác giả thời Trung cổ nghĩ rằng nó có nghĩa là "đuôi vẫy", từ đó mà phát sinh từ Latinh mới cilla để chỉ "đuôi".[4] Tính từ định danh citreola là từ Latinh để chỉ "màu vàng chanh".[5]